Gracias a genio_mex por esta mini-guía 
Previamente deben tener ya su tema extraido con el SISContents.
Para modificar el tema default necesitarán editar el archivo rofs3.prd.fpsx. Descarguen el archivo del Navifirm y extraigan con el NokiaEditor, seguramente no aparecerá en la lista de archivo, así que seleccionen "ALL" y ábranlo.
Luego diríjanse a ROFS2 y copien los archivos del tema extraido con el SISContents a las rutas especificadas.
Ahora vayan a la carpeta ROFS2\private\10202be9y abran el único archivo que hay, luego encuentren la siguiente línea:
0x14 string "4cb2cc26755f9c77" 0 cap_rd=alwayspass cap_wr=alwaysfail
En la línea en rojo, entre las comillas coloquen el nombre de la carpeta que almacene su tema.
Guarden el archivo y por ultimo "repackeen".
Listo, ahora a flashear y a disfrutar.
Si no llegase a funcionar eliminen el archivo 101F876F.cre en la carpeta C:\private\10202be9\persist y reinicien su celular.
Nota: Recomiendo poner un solo tema en el ROFS3, que no se sobrepase de 10MB (aunque realmente no sé cual sea el límite real).
Saludos.
PD: Esto arregla el fallo de que cuando se flashea el CFW,sale un theme en blanco y no el theme que nosotros queremos para nuestro CFW.